Em 1968, o Sr. Manoel Fachetti doou um terreno à Comunidade do Bairro Maria das Graças, com o objetivo de construir uma escola que atendesse os moradores.
Construindo o prédio, a Escola começou a funcionar com turmas de ginásio (5ª a 8ª séries), e com o nome de Escola Cenecista - CNEC (Campanha Nacional Escola - Comunidade).
O primeiro diretor foi o Professor Edson M. Negrelli, que administrou de 1968 a 1983. Em 1984, assumiu a Professora Ana Cenair Viganô, que foi sucedida pelo Professor Valdir José Dias (1985 a 1987). A última diretora da CNEC foi a Professora Aldecir Ferreira Cipestre Mascarelo, pois em 1988 a Escola foi desativada, funcionando apenas como "Pré-Vestibular José Fachetti". O nome "José Fachetti" foi dado em homenagem ao pai do doador do terreno.
Em 1992, a EEEFM "Geraldo Vargas Nogueira", utilizou o prédio como extensão da mesma, colocando em funcionamento três turmas de 5ª série e duas turmas de 6ª série. Nessa época, a Escola teve como diretora a Professora Edna Solange Ferrari, funcionando assim por dois anos.
No ano de 1994 foi criada a EGP "José Fachetti" (Escola de 1º Grau "José Fachetti"), cuja criação foi publicada no Diário Oficial de 25/02/94, sob a Portaria nº 3021 de 22/04/94, com o objetivo de atender alunos de 5ª a 8ª série. Tendo como primeira diretora a Professora Eliane Rose Lopes Guerra, que atuou nessa função por dois anos.
Em 1996, a Professora Lenir Bianchi assumiu a direção, ficando até o final de 1997.
Em 1998, a Escola entrou em processo de municipalização, de acordo como Decreto 8404, passando a pertencer à Prefeitura Municipal de Colatina, e a chamar-se EPGM "José Fachetti" (Escola de 1º Grau Municipal "José Fachetti"), sob a direção da Professora Sandra Helena Saquetto Seidel.
Dois anos depois, através do Decreto nº 9475 de 10 de janeiro de 2002, passa a ser denominada EMEF "José Fachetti".
Em Maio de 2003, a Professora Sâmia Torres do Vallis assume a direção da Escola, após processo eleitoral, em cumprimento ao Decreto nº 9800/2003, tendo como coordenadora a Professora Karla Carvalho Sarcinelli.
Após novo processo eleitoral, Karla Carvalho Sarcinelli assume a direção da Escola em 14/07/06, em cumprimento ao Decreto nº 11343/2006, tendo como coordenadora as Professoras Juliana Fassina Fereguetti e Ivete Pimentel Miranda Viana.